More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3878 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  94.16 
 
 
428 aa  811  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  81.22 
 
 
423 aa  682  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  81.22 
 
 
423 aa  682  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  94.16 
 
 
428 aa  814  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  847  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  94.39 
 
 
428 aa  816  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  88.83 
 
 
428 aa  743  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  71.29 
 
 
432 aa  606  1e-172  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  71.05 
 
 
432 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  70.81 
 
 
432 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  69.52 
 
 
432 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  70.6 
 
 
434 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  70.6 
 
 
434 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  67.62 
 
 
435 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  64.35 
 
 
433 aa  541  1e-152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  55.88 
 
 
429 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  58.06 
 
 
430 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  55.67 
 
 
429 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  56.9 
 
 
427 aa  471  1e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  55.99 
 
 
411 aa  467  1e-130  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
436 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  55.37 
 
 
434 aa  458  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  56.27 
 
 
428 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  55.37 
 
 
437 aa  446  1e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  53.32 
 
 
409 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  53.32 
 
 
409 aa  441  1e-122  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  54.03 
 
 
420 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  54.03 
 
 
420 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  53.19 
 
 
423 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  52.94 
 
 
409 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  53.79 
 
 
420 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  54.03 
 
 
420 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  53.81 
 
 
420 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  52.64 
 
 
429 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 
434 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  56.55 
 
 
429 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  52.66 
 
 
445 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  52.78 
 
 
445 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  52.78 
 
 
428 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 
415 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  52.55 
 
 
415 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 
419 aa  416  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  2.94686e-06 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  51.94 
 
 
416 aa  417  1e-115  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  51.84 
 
 
419 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  52.21 
 
 
425 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  50.82 
 
 
425 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  49.64 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  53.09 
 
 
423 aa  405  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  49.15 
 
 
429 aa  405  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
457 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
474 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
474 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
457 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
474 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  48.01 
 
 
474 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  51.71 
 
 
430 aa  401  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  49.39 
 
 
424 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  53.16 
 
 
421 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  47.78 
 
 
474 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  49.39 
 
 
424 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  48.91 
 
 
424 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  49.76 
 
 
435 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  52.73 
 
 
398 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  52.73 
 
 
398 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  50.24 
 
 
432 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  52.73 
 
 
398 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 
423 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  48.5 
 
 
436 aa  355  8e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  47.56 
 
 
433 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  44.12 
 
 
441 aa  342  6e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  43.55 
 
 
428 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  43.07 
 
 
428 aa  326  4e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  44.72 
 
 
436 aa  322  1e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  48.02 
 
 
411 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  33.95 
 
 
415 aa  221  2e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  35.28 
 
 
491 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  34.73 
 
 
418 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.11 
 
 
415 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  35.52 
 
 
412 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  33.33 
 
 
415 aa  202  1e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  33.59 
 
 
415 aa  201  2e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  34.41 
 
 
412 aa  198  1e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.74 
 
 
432 aa  199  1e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.91 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.21 
 
 
432 aa  197  4e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.51 
 
 
432 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
432 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.37 
 
 
433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.66 
 
 
432 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.58 
 
 
433 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  34.99 
 
 
410 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55107e-07 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.1 
 
 
415 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  33.85 
 
 
415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  33.85 
 
 
415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.76 
 
 
410 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  33.49 
 
 
418 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.19 
 
 
408 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
410 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  7.90745e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>