131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3714 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  100 
 
 		 361 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  51.18 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  35.16 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  30.93 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  31.34 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  30.67 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  32.51 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  30.65 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  28.86 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  27.3 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  30.09 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  26.44 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  26.75 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  27.33 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  22.76 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  24.79 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  22.31 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  22.02 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  23.89 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  24.73 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  23.06 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.16 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  23.55 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  23.24 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  24.65 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  26.84 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  22.37 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  25.41 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.71 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  23.71 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  23.28 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  23.12 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  23.67 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  26.39 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  26.33 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  23.05 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  22.19 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  22.54 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  22.57 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  22.11 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.92 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  25.4 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.93 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.94 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  23.65 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  22.47 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  24.85 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  24.55 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  24.3 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  24.79 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  23.94 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.3 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  21.43 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 513 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  24 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  23.63 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  25.96 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  34.74 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 2112 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  24.08 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  30 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  21.49 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.71 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  23.36 
 
 		 378 aa  49.3  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  24.13 
 
 		 427 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.78 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  23.53 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  22.65 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  22.95 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  20.54 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  22.96 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  21.66 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  34.02 
 
 		 252 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29 
 
 		 237 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 246 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  26.4 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  28.3 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>