65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3705 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  64.57 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  43.33 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  38.58 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  38.13 
 
 		 442 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  41.84 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  41.84 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  40.05 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  39.04 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  39.35 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  36.43 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  29.03 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  26.15 
 
 		 629 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  23.91 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  21.37 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  25.43 
 
 		 626 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.57 
 
 		 833 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  26.48 
 
 		 823 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 826 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.95 
 
 		 821 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.45 
 
 		 841 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  22.99 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25.96 
 
 		 822 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.25 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  29.29 
 
 		 826 aa  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  26.16 
 
 		 820 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  22.05 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.1 
 
 		 891 aa  63.2  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 822 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  30.05 
 
 		 833 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  24.14 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  23.66 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  26.13 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 826 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 826 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 839 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  24.78 
 
 		 841 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  25.99 
 
 		 825 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.77 
 
 		 824 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  22.92 
 
 		 604 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.17 
 
 		 758 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.45 
 
 		 607 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  22.6 
 
 		 626 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.82 
 
 		 661 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  27.39 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25.1 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  21.23 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  25.65 
 
 		 605 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  26.27 
 
 		 589 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  23.73 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  24.57 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  22.69 
 
 		 632 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  26.59 
 
 		 871 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  21.99 
 
 		 638 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  24.03 
 
 		 648 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  21.57 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  21.77 
 
 		 638 aa  47  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  22.22 
 
 		 605 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  22.47 
 
 		 649 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  23.65 
 
 		 671 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  21.41 
 
 		 653 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  22.93 
 
 		 812 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  28.21 
 
 		 239 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  43.5  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>