153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3692 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  84.62 
 
 
260 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  84.92 
 
 
264 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  85.26 
 
 
263 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  70.24 
 
 
272 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  70.28 
 
 
272 aa  327  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  67.6 
 
 
267 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  62.99 
 
 
268 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  63.26 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  61.42 
 
 
266 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  38.78 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  41.38 
 
 
243 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  35.35 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  36.65 
 
 
242 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.85 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  32 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  32.91 
 
 
339 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.28 
 
 
233 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  30.65 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  30.88 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  31.16 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  28.02 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  27.41 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  29.72 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  29.9 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  30 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  32.57 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  29.52 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  29.25 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  29.52 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  29.21 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.91 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  33.33 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  34.13 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  31.98 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  29.36 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  27 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  27 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  24.37 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  29.94 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.72 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  25.79 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  29.05 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  28.3 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  28.16 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  28.71 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  27.08 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.91 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  30.69 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  31.33 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.74 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  25.93 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  30.39 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.27 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.83 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  25.99 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  30.72 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  25.32 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  28.98 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  28.82 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  25.31 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  25.85 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  28.86 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  26.89 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  31.38 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  25.6 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  25.6 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.82 
 
 
375 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  31.06 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  32.97 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  28.5 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  24.88 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  26.88 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  25.76 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  31.25 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.54 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 
207 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  26.42 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  24.38 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1593  flagellar assembly protein H  29.63 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.01 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  24.14 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  29.05 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  22.44 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  29.78 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  31.48 
 
 
201 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.45 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  26.25 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  26.52 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>