More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3664 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  87.33 
 
 		 747 aa  1186    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  59.71 
 
 		 733 aa  814    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  55.91 
 
 		 714 aa  791    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  57.75 
 
 		 758 aa  809    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  79.31 
 
 		 748 aa  1076    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  51.57 
 
 		 739 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.86 
 
 		 719 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  57.25 
 
 		 746 aa  803    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  77.65 
 
 		 758 aa  1092    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  74.38 
 
 		 748 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  59.19 
 
 		 744 aa  815    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 739 aa  1476    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  58.25 
 
 		 747 aa  821    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  80.4 
 
 		 754 aa  1090    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  57.18 
 
 		 741 aa  827    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  62.3 
 
 		 723 aa  872    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  58.37 
 
 		 747 aa  819    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  57.94 
 
 		 751 aa  841    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  79.87 
 
 		 737 aa  1068    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  64.87 
 
 		 691 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  86.82 
 
 		 747 aa  1200    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 		 738 aa  806    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  63.47 
 
 		 767 aa  919    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  89.01 
 
 		 743 aa  1223    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  63.13 
 
 		 745 aa  892    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  58.71 
 
 		 734 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  56.82 
 
 		 785 aa  816    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  59.97 
 
 		 746 aa  829    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  55.44 
 
 		 754 aa  792    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  57.64 
 
 		 760 aa  824    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  57.81 
 
 		 762 aa  813    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  53.38 
 
 		 734 aa  719    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  58.65 
 
 		 736 aa  825    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  74.45 
 
 		 753 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  57.94 
 
 		 762 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  58.79 
 
 		 733 aa  820    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  58.51 
 
 		 741 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.25 
 
 		 759 aa  817    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  60.52 
 
 		 709 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  59.27 
 
 		 744 aa  825    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  55.08 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 770 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 		 614 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  58.02 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  58.02 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 701 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 687 aa  405  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  41.47 
 
 		 769 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  46.62 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  41.1 
 
 		 769 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  42.97 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  47.16 
 
 		 785 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 713 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.58 
 
 		 770 aa  383  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.15 
 
 		 783 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.12 
 
 		 639 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  42.37 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 697 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 598 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 603 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  46.52 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  47.12 
 
 		 604 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 606 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 607 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.06 
 
 		 770 aa  369  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 724 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 695 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.38 
 
 		 610 aa  361  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 728 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.56 
 
 		 704 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.94 
 
 		 720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  32.61 
 
 		 692 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.65 
 
 		 677 aa  353  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 670 aa  352  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  34.5 
 
 		 702 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 701 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 686 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 671 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 		 673 aa  347  5e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.4 
 
 		 766 aa  346  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 671 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 660 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.34 
 
 		 927 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 695 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  33.51 
 
 		 669 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 673 aa  344  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 728 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 		 635 aa  343  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  33.16 
 
 		 736 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  46.63 
 
 		 701 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  34.63 
 
 		 783 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  45.45 
 
 		 692 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.54 
 
 		 784 aa  340  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 690 aa  340  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 671 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>