214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3537 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  70.47 
 
 		 462 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  73.21 
 
 		 447 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  74.61 
 
 		 464 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  75.06 
 
 		 456 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  77.68 
 
 		 448 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  75.78 
 
 		 448 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 450 aa  922    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  69.04 
 
 		 448 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  69.21 
 
 		 472 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  64.84 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  45.93 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  35.8 
 
 		 402 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  36.72 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30.05 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  32.68 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  31.66 
 
 		 409 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  30.85 
 
 		 350 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  32.03 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.43 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  31.98 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  30.79 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.9 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.48 
 
 		 602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.5 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.95 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  28.73 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.24 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.33 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  27.39 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.86 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  31.48 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  30.72 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.1 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.3 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.78 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.08 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  30.65 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  26.58 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.11 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.92 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.22 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.16 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  25.56 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  26 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  26.47 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  24.81 
 
 		 352 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.45 
 
 		 342 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.67 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  23.06 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  31.76 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  22.99 
 
 		 317 aa  94.4  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  24.57 
 
 		 352 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  26.69 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  25.98 
 
 		 353 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  25.73 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  24.38 
 
 		 355 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  25.86 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  27.24 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  24.52 
 
 		 349 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  24.52 
 
 		 349 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  31.76 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  24.53 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  24.62 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  26.9 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  23.64 
 
 		 346 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  24.62 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.95 
 
 		 313 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.07 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  23.91 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.56 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  21.29 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  25.88 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  21.82 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  23.14 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  24.75 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  21.29 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  21.29 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  22.07 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  22.07 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  21.31 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  22.07 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  21.29 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  22.07 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  20.98 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  26.13 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  24.26 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  20.98 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  21.65 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  20.98 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  22.3 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  21.1 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  24.77 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  21.95 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  20.8 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.07 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  21.97 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  21.65 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  22.16 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>