More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3522 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  92.89 
 
 
270 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  92.89 
 
 
270 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  92.03 
 
 
270 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  73.68 
 
 
270 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  74.9 
 
 
271 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  71.22 
 
 
271 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  67.28 
 
 
270 aa  359  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  66.93 
 
 
269 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  67.62 
 
 
269 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  55.88 
 
 
270 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.82 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
296 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.88 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  34.88 
 
 
260 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.22 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  39.27 
 
 
264 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.17 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.17 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.04 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.01 
 
 
286 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 
288 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
311 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  43.24 
 
 
398 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
416 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 
587 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
360 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.44 
 
 
890 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 
537 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
417 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
630 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  41.28 
 
 
631 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  89  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
220 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
220 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
220 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
220 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
169 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
220 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  89  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  42.45 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
543 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.34 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  40.57 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.5 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 
542 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  37.84 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.45 
 
 
694 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.84 
 
 
209 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  42.99 
 
 
558 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
231 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  36.44 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 
544 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  38.57 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 
468 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.57 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.46 
 
 
707 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.68 
 
 
620 aa  82  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  32.39 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  42.72 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.8 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  36.84 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.36 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.86 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  38 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  39.02 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.31 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  41.51 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  36.17 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  41.51 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.07 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  41.67 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>