More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3501 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  95.02 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  95.02 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  94.61 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  73.22 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  73.03 
 
 		 242 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  71.97 
 
 		 242 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  67.92 
 
 		 241 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  67.08 
 
 		 241 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  52.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  52.1 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  44.55 
 
 		 261 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  45.89 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  43.83 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  43.33 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  41.15 
 
 		 264 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  40.74 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  38.33 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  37.76 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  38.62 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  37.29 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  37.66 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  36.73 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  39.34 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  39.44 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  39.23 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.86 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  35.21 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  39.08 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  38.28 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  33.75 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  36.49 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  38.57 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  37.93 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  34.55 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.95 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  35.11 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  39.57 
 
 		 237 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  40.19 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  30.64 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  31.76 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  29.8 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  34.11 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  33.49 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  34.1 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  34.26 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  33.64 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  33.94 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  40.36 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  33.18 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  29.3 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  28.98 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  32.65 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  35.44 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  35.02 
 
 		 356 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  35.02 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  35.02 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  26.19 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.22 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  36.32 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  30.37 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.66 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  27.49 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  27.49 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  27.49 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.45 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.66 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.53 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  31.82 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  24.39 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.34 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  30.73 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.33 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  28.18 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.92 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.98 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  29.02 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2133  dienelactone hydrolase  31.52 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>