184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3486 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  93.79 
 
 
564 aa  1011    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  81.38 
 
 
564 aa  919    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  81.74 
 
 
564 aa  923    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4033  potassium-transporting ATPase subunit A  84.57 
 
 
564 aa  899    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.845156  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  60.87 
 
 
569 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  94.86 
 
 
564 aa  1021    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  81.74 
 
 
564 aa  882    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3486  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 
564 aa  1119    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1707  potassium-transporting ATPase subunit A  94.33 
 
 
564 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  81.74 
 
 
564 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.96 
 
 
569 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  56.2 
 
 
571 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  57.04 
 
 
567 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  56.91 
 
 
571 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  55.23 
 
 
567 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  58.09 
 
 
579 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  55.72 
 
 
567 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  57.48 
 
 
571 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  57.48 
 
 
571 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  55.34 
 
 
562 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  55.78 
 
 
567 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  55.34 
 
 
562 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  54.76 
 
 
561 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  55.34 
 
 
562 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  53.19 
 
 
578 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  56.41 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  53.82 
 
 
569 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  56.08 
 
 
567 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  53.74 
 
 
567 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  57.25 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  54.18 
 
 
571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  57.45 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  54.08 
 
 
567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  57.06 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  57.06 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  57.06 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  57.06 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  52.71 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  57.06 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  56.67 
 
 
557 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  57.06 
 
 
557 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  53.38 
 
 
567 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  55.52 
 
 
562 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  57.12 
 
 
571 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  54.96 
 
 
559 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  51.86 
 
 
592 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  54.96 
 
 
559 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  55.14 
 
 
559 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  56.98 
 
 
559 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  52.12 
 
 
610 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2923  potassium-transporting ATPase subunit A  59.77 
 
 
551 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.519235  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1265  potassium-transporting ATPase subunit A  59.57 
 
 
551 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  54.96 
 
 
559 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.45 
 
 
582 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2577  potassium-transporting ATPase subunit A  51.4 
 
 
612 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  53.9 
 
 
562 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.69 
 
 
572 aa  551  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  52.58 
 
 
586 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  51.43 
 
 
605 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  51.62 
 
 
590 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0053  potassium-transporting ATPase subunit A  54.23 
 
 
569 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350618  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  53.01 
 
 
574 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  52.14 
 
 
571 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  50.53 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  54.51 
 
 
575 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2927  potassium-transporting ATPase subunit A  53.75 
 
 
561 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  48.9 
 
 
592 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.19 
 
 
567 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  50.51 
 
 
592 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1677  potassium-transporting ATPase subunit A  52.86 
 
 
583 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  50.94 
 
 
590 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  50.77 
 
 
590 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  51.54 
 
 
595 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.85 
 
 
568 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  51.85 
 
 
601 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  49.5 
 
 
601 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  53.03 
 
 
599 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  52.28 
 
 
576 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  50.26 
 
 
601 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  49.33 
 
 
601 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  49.33 
 
 
601 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.95 
 
 
572 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  53.15 
 
 
569 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  49.33 
 
 
601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  49.33 
 
 
601 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  49.33 
 
 
601 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1178  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.63 
 
 
564 aa  513  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2846  potassium-transporting ATPase subunit A  48.98 
 
 
591 aa  515  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.84634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  47.88 
 
 
594 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4242  potassium-transporting ATPase subunit A  52.41 
 
 
569 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1885  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.26 
 
 
583 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.345668 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2232  K+-transporting ATPase, A subunit  50.26 
 
 
583 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.110931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1096  potassium-transporting ATPase subunit A  53.7 
 
 
568 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2102  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.63 
 
 
583 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.327309  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  50.43 
 
 
602 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0717  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.91 
 
 
576 aa  500  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000927315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2475  K+-transporting ATPase, A subunit  50.63 
 
 
583 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0830  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.62 
 
 
566 aa  497  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  46.34 
 
 
811 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2057  potassium-transporting ATPase subunit A  51.69 
 
 
601 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0612031  normal  0.429028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>