More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3257 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 576 aa  1166    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  37.87 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  39.04 
 
 		 578 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  38.53 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  39.72 
 
 		 550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  36.64 
 
 		 569 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 575 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  33.88 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  65.85 
 
 		 383 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  28.11 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 552 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  32.99 
 
 		 555 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  32.23 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  31.89 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  31.89 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  32.41 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  42.2 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  41.28 
 
 		 560 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.19 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  42.98 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  37.96 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  40.87 
 
 		 890 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.19 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.48 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.88 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  39.42 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 344 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  44 
 
 		 214 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.95 
 
 		 267 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.44 
 
 		 321 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.07 
 
 		 241 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.34 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.04 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.54 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.94 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.94 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  42.57 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  37.72 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  39.42 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  29.38 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.42 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 		 640 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 236 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 224 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 		 243 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>