176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3245 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  68.26 
 
 		 587 aa  841    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  68.77 
 
 		 587 aa  845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  68.43 
 
 		 587 aa  843    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  68.43 
 
 		 587 aa  840    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  66.21 
 
 		 584 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  100 
 
 		 589 aa  1206    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  52.32 
 
 		 606 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  53.4 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  51.66 
 
 		 604 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  33.79 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  33.77 
 
 		 596 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  32.67 
 
 		 595 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  34.08 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.74 
 
 		 590 aa  270  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  33.73 
 
 		 595 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  31.96 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  29.65 
 
 		 606 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  29.65 
 
 		 606 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  29.97 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  28.94 
 
 		 582 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  31.54 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  31.61 
 
 		 589 aa  253  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.83 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.49 
 
 		 588 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  29.9 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.09 
 
 		 588 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.49 
 
 		 611 aa  240  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  29.97 
 
 		 588 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.03 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  29.55 
 
 		 588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  33.11 
 
 		 580 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  32.94 
 
 		 580 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.55 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  33.11 
 
 		 577 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  29.42 
 
 		 610 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  32.82 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  32.43 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  29.77 
 
 		 619 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  29.61 
 
 		 619 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  28.26 
 
 		 610 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  28.28 
 
 		 583 aa  217  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  28.89 
 
 		 625 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  27.55 
 
 		 616 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  27.48 
 
 		 617 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.22 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  27.55 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  27.55 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  27.48 
 
 		 617 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  28.81 
 
 		 606 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  31.31 
 
 		 580 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  28.81 
 
 		 606 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  29.37 
 
 		 606 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  29.58 
 
 		 517 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  29.13 
 
 		 619 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  28.43 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  30.87 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.3 
 
 		 590 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  30.68 
 
 		 629 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.9 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  30.08 
 
 		 629 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  30.08 
 
 		 629 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  28.64 
 
 		 605 aa  203  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  29.23 
 
 		 629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  29.92 
 
 		 629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  29.92 
 
 		 629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  29.92 
 
 		 629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  29.92 
 
 		 629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.04 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  29.97 
 
 		 624 aa  197  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  28.82 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  28.41 
 
 		 623 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.82 
 
 		 630 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  27.34 
 
 		 628 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  28.34 
 
 		 623 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  26.87 
 
 		 616 aa  193  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  28.66 
 
 		 623 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  26.86 
 
 		 611 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  26.86 
 
 		 611 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  26.86 
 
 		 611 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  28.5 
 
 		 629 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  26.86 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  26.86 
 
 		 611 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.86 
 
 		 624 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.75 
 
 		 629 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  29.7 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  26.7 
 
 		 611 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.51 
 
 		 626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  27.89 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  26.19 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  26.19 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>