More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3192 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  85.65 
 
 		 217 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  85.19 
 
 		 216 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  84.72 
 
 		 216 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  57.3 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  56.76 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  42.2 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  50.54 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  48.54 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  47.43 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  41.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  41.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  41.55 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  51.11 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  41.55 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  46.59 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  46.02 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  44.89 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  44.25 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  40.19 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  42.53 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  42.53 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  41.38 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  38.22 
 
 		 271 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  37.22 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  39.41 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  36.67 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.62 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  37.99 
 
 		 205 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  37.72 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  35.75 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  32.63 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  36.07 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.31 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.23 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.44 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.05 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  35.63 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  39.88 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  34.64 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  34.86 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  31.05 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  35.59 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  36.05 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  35.36 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  36.07 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  34.42 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  35.2 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  34.86 
 
 		 281 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  34.78 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  36.32 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  35.5 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  35.5 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  35.5 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  35.5 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  35.5 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  35.5 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  38.12 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  35.5 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0542  putative cytochrome c  34.48 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 236 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  37.06 
 
 		 239 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.22 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  36.72 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>