180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3146 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  65.03 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  68.61 
 
 		 147 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  69.47 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  63.43 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  54.01 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  50 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  50 
 
 		 181 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  50 
 
 		 203 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  50 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.11 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 188 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  51.88 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  51.75 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  47.76 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  50.71 
 
 		 163 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  49.65 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  49.3 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  48.85 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  48.67 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  46.27 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.88 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  42.54 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.27 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.92 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  24.26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.57 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  28.35 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 286 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>