220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3128 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  58.89 
 
 		 186 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.91 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.93 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  59.12 
 
 		 184 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  56.67 
 
 		 188 aa  227  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.97 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.41 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.15 
 
 		 176 aa  204  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  46.59 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  47.19 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  48.3 
 
 		 177 aa  190  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  48.28 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  43.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  44.79 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  39.77 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.78 
 
 		 123 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.37 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.37 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  37.42 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  36 
 
 		 180 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  39.87 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  35.68 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 205 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.99 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  33.71 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.06 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.09 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.84 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.06 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  33.53 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.95 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  32.94 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  34.09 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.56 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.73 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.71 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.93 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.45 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.45 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  32.33 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.48 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.88 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  26.02 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.82 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.07 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.08 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  28.07 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.95 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  28.07 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.11 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  32.16 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  28.89 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  31.11 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  31.11 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  27.21 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.67 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.74 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.89 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.12 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.85 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  23.31 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  27.74 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.08 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  28.91 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  27.07 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  35.71 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>