292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3105 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 
211 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  45.86 
 
 
202 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 
207 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4351  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
224 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.85 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
208 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
208 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.78 
 
 
206 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.17 
 
 
206 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.31 
 
 
203 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.84 
 
 
202 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
199 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
199 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.5 
 
 
216 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.78 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  33.15 
 
 
209 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.91 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
199 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.39 
 
 
202 aa  92  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
204 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.41 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  34.9 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  34.9 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  34.9 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.33 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31.05 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.65 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.54 
 
 
199 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.65 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.71 
 
 
207 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  34.24 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.19 
 
 
213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.24 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.24 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  34.24 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  34.24 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  34.24 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  34.24 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  34.24 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  33.7 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  32.97 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.71 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.66 
 
 
202 aa  85.1  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 
197 aa  85.1  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  35.06 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.55 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  41.82 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  36.14 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.55 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.12 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  32.24 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  32.04 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.82 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  32.24 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  32.24 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  32.24 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  32.24 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  33.33 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.77 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2463  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.94 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  35.54 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.18 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.18 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  35.54 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.18 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.18 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.18 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.18 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.18 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.85 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  31.49 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  32.04 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.81 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.34 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.8 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  35.54 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.41 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.9 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>