263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3104 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
149 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.81 
 
 
148 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4015  carboxymuconolactone decarboxylase  70.95 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0483947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  55.48 
 
 
151 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  54.11 
 
 
151 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  53.42 
 
 
151 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  53.1 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  51.37 
 
 
151 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  51.37 
 
 
151 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.68 
 
 
151 aa  158  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.08 
 
 
151 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.97 
 
 
153 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
157 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
145 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.76 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.22 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.29 
 
 
163 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  45.14 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.43 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.45 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.54 
 
 
155 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.57 
 
 
163 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.97 
 
 
146 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
153 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
163 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
159 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.14 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.45 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.45 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.14 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  44.14 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
145 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.57 
 
 
155 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
162 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
145 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.45 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.97 
 
 
150 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.97 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
146 aa  114  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
157 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.5 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  36.17 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
145 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.21 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.41 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.94 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  37.67 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.59 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.86 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.13 
 
 
143 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  37.06 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.76 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.86 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  41.67 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.14 
 
 
152 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.43 
 
 
143 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.43 
 
 
144 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.43 
 
 
144 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.76 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
149 aa  106  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  40.43 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.43 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  40.43 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.17 
 
 
153 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.98 
 
 
151 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  35.97 
 
 
149 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  39.04 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 
143 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.75 
 
 
154 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
151 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.54 
 
 
153 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  38.56 
 
 
156 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
167 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
149 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 
149 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  37.59 
 
 
159 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 
159 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  48.33 
 
 
156 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.97 
 
 
160 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>