More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3093 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  80.57 
 
 		 219 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  80.09 
 
 		 219 aa  362  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  80.09 
 
 		 219 aa  361  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  77.73 
 
 		 219 aa  357  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  76.39 
 
 		 219 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  75.71 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  75.71 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  75.71 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  74.07 
 
 		 217 aa  344  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  73.06 
 
 		 219 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  73.06 
 
 		 219 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  73.06 
 
 		 219 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  73.06 
 
 		 219 aa  343  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  73.06 
 
 		 219 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  73.06 
 
 		 219 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  72.81 
 
 		 234 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  73.33 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  73.33 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  71.96 
 
 		 219 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  71.43 
 
 		 219 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  69.16 
 
 		 220 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  68.72 
 
 		 220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  68.37 
 
 		 219 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  71.01 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  67.14 
 
 		 211 aa  310  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  67.46 
 
 		 211 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  65.89 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  66.99 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  62.56 
 
 		 211 aa  290  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  62.56 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  64.11 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  49.54 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  49.08 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  48.62 
 
 		 239 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  48.62 
 
 		 239 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  48.39 
 
 		 243 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  48.64 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  50.74 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  47.27 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  49.3 
 
 		 242 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  48.83 
 
 		 242 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  50.25 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  53.06 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  48.31 
 
 		 230 aa  204  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  49.03 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  49.75 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  49.28 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  47.34 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  45.81 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  42.36 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  46.86 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  45.05 
 
 		 258 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  45.41 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  44.66 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  43.58 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  46.5 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  45.1 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  42.08 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  38.19 
 
 		 356 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  42.23 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  39.91 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  40.5 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  44.55 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  36.7 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  45.96 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  36.92 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  34.78 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 877 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  34.16 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  33.18 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  35.84 
 
 		 255 aa  131  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  32.7 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>