More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2920 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  76.76 
 
 		 185 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  76.22 
 
 		 185 aa  290  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  76.22 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  39.87 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  35.93 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.12 
 
 		 209 aa  84.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.5 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.14 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.68 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.65 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 473 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.48 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  36.03 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  30.72 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 347 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  33.54 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  34.85 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.75 
 
 		 277 aa  72  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 378 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.82 
 
 		 351 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.82 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.82 
 
 		 348 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.82 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.82 
 
 		 348 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.01 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.08 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.12 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  24.56 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.81 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.29 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  35.77 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 378 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.49 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  30.77 
 
 		 352 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  31.74 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.41 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.35 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>