More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2903 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  88.79 
 
 
473 aa  868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  100 
 
 
472 aa  962    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  89.43 
 
 
473 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  89.03 
 
 
473 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.41 
 
 
472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  41.7 
 
 
464 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2816  sugar transferase  41.52 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  39.87 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.45 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.4 
 
 
460 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  38.52 
 
 
477 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.04 
 
 
471 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.75 
 
 
464 aa  276  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.15 
 
 
464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.29 
 
 
477 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  36.94 
 
 
465 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.58 
 
 
465 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.44 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  44.44 
 
 
464 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  44.44 
 
 
464 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.44 
 
 
464 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.44 
 
 
464 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.14 
 
 
464 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.07 
 
 
465 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  37.47 
 
 
457 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.14 
 
 
464 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.6 
 
 
471 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.73 
 
 
445 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.1 
 
 
465 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.21 
 
 
466 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  34.74 
 
 
464 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.72 
 
 
496 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.1 
 
 
454 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.39 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.35 
 
 
461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  38.39 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  38.39 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  37.47 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.86 
 
 
461 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.47 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  35.29 
 
 
460 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  35.29 
 
 
460 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.47 
 
 
460 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  35.29 
 
 
460 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.51 
 
 
461 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  35.51 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.31 
 
 
465 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  37.77 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.99 
 
 
465 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.64 
 
 
468 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.51 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  35.51 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.3 
 
 
506 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  38.13 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.52 
 
 
346 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.75 
 
 
464 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.75 
 
 
464 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.75 
 
 
464 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  44.75 
 
 
464 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.36 
 
 
464 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  41.62 
 
 
464 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  37.62 
 
 
484 aa  259  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1801  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.16 
 
 
460 aa  259  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2712  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.49 
 
 
505 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.104173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.8 
 
 
461 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.19 
 
 
518 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.33 
 
 
459 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.3 
 
 
464 aa  256  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  41.59 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.47 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.3 
 
 
471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  37.47 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.73 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  40.36 
 
 
471 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2955  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.64 
 
 
506 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622356  normal  0.0348556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0584  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.36 
 
 
468 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.2 
 
 
461 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1925  sugar transferase  42.45 
 
 
506 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.73 
 
 
468 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3301  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.18 
 
 
478 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.78 
 
 
461 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  35.68 
 
 
466 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3529  capsular polysaccharide biosynthesis protein PslA  36.4 
 
 
478 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  34.36 
 
 
514 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.28 
 
 
475 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  40.35 
 
 
459 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.21 
 
 
517 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2694  sugar transferase  35.06 
 
 
509 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335678  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.19 
 
 
468 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.19 
 
 
468 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.19 
 
 
468 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2028  sugar transferase  34.74 
 
 
461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.619807  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  37.39 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  35.37 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5198  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.97 
 
 
465 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.98 
 
 
471 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2191  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.47 
 
 
518 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.894429  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1856  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.47 
 
 
536 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.726353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.6 
 
 
501 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1875  sugar transferase  34.54 
 
 
477 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>