208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2902 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  100 
 
 
553 aa  1133    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  27.12 
 
 
589 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  26.49 
 
 
565 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  25.05 
 
 
577 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  146  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  24.86 
 
 
577 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  24.86 
 
 
577 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  30.84 
 
 
575 aa  143  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  27.29 
 
 
571 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  24.68 
 
 
577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  25.17 
 
 
600 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  26.77 
 
 
600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1723  type III effector HopAH2-2  26.28 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  26.33 
 
 
583 aa  134  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  29.3 
 
 
584 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  28.44 
 
 
592 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  29.62 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  25.05 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  28.03 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  28.92 
 
 
565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  28.92 
 
 
565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  28.92 
 
 
565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  28.92 
 
 
565 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  33.87 
 
 
515 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  30.59 
 
 
552 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  33.2 
 
 
505 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  33.2 
 
 
541 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  33.2 
 
 
541 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  33.2 
 
 
541 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  31.37 
 
 
544 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  33.2 
 
 
541 aa  127  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  33.2 
 
 
541 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  33.2 
 
 
547 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  33.2 
 
 
505 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  30 
 
 
557 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0044  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  27.18 
 
 
510 aa  123  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03985  predicted metal dependent hydrolase  32.17 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4579  putative cell division protein  32.17 
 
 
547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03946  hypothetical protein  32.17 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3878  sulfatase  32.17 
 
 
557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  26.74 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3913  putative cell division protein  32.17 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.482913  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5627  putative cell division protein  32.17 
 
 
547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4354  putative cell division protein  32.17 
 
 
557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4668  putative cell division protein  32.17 
 
 
557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.89 
 
 
555 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  26.74 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  28.62 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  28.62 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1725  sulfatase, putative  27.96 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  31.01 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2037  sulfatase  30.07 
 
 
518 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  27.97 
 
 
545 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  31.61 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  31.61 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  27.86 
 
 
532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  31.61 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  31.61 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0283  sulfatase, putative  27.36 
 
 
512 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0021  sulfatase  28.57 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3835  putative cell division protein  31.48 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.830183  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0306  sulfatase, putative  26.91 
 
 
512 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  25.43 
 
 
551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  29.41 
 
 
567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  27.24 
 
 
549 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  24.8 
 
 
549 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  30.5 
 
 
553 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  28.61 
 
 
520 aa  113  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1931  sulfatase  27.93 
 
 
582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.514301  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  27.41 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4015  putative cell division protein  31.38 
 
 
548 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  26.77 
 
 
541 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  23.91 
 
 
564 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  28.75 
 
 
549 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  27.38 
 
 
544 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4143  phosphoethanolamine transferase  27.62 
 
 
560 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  30.55 
 
 
543 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  29.19 
 
 
572 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0131  phosphoethanolamine transferase  28.37 
 
 
564 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.173638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  26.25 
 
 
560 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  28.85 
 
 
544 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  28.53 
 
 
544 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  27.87 
 
 
551 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  29.35 
 
 
544 aa  109  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1859  phosphoethanolamine transferase  27.96 
 
 
554 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  27.1 
 
 
545 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  30.32 
 
 
550 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  32.94 
 
 
532 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  29.08 
 
 
545 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  29.68 
 
 
575 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00378  putative sulfatase  28.15 
 
 
300 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  26.65 
 
 
551 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>