17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2863 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  82.98 
 
 		 51 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  80.85 
 
 		 51 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  76.6 
 
 		 51 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  65.91 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  68.09 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  65.96 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  46.55 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  65.85 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1178  hypothetical protein  76.6 
 
 		 53 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  65.96 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1366  hypothetical protein  62.75 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  54.76 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  63.83 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0777  hypothetical protein  40.32 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2649  hypothetical protein  52.27 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  normal  0.0307301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  55 
 
 		 53 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>