27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2849 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  86.54 
 
 
161 aa  284  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  86.54 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  85.26 
 
 
161 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  64.74 
 
 
163 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  63.46 
 
 
167 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  68.03 
 
 
161 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  68.03 
 
 
161 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  59.09 
 
 
154 aa  190  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  57.79 
 
 
154 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  58.82 
 
 
168 aa  184  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  35.56 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  34.75 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  25.27 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  23.08 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  27.05 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  27.05 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  23.84 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  23.08 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  22.53 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  23.08 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  22.53 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  22.53 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  22.53 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  22.53 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>