More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2805 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  95.73 
 
 		 398 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  817    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  95.73 
 
 		 398 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  95.48 
 
 		 398 aa  780    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  72.04 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  71.54 
 
 		 397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  71.28 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  70.96 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  70.96 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  70.96 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  70.96 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  70.96 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  70.71 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  70.71 
 
 		 411 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  70.71 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  70.78 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  69.95 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0753  aromatic amino acid aminotransferase  70.28 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137496  normal  0.117854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  69.7 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0735  aromatic amino acid aminotransferase  71.54 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.160604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  69.7 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  69.44 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  69.44 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  69.44 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3853  aromatic amino acid aminotransferase  70.78 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4643  aromatic amino acid aminotransferase  69.19 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.319396  normal  0.236394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3763  aromatic amino acid aminotransferase  70.53 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  65.66 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  65.4 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  61.62 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  62.72 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  59.05 
 
 		 405 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  57.36 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  57.11 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  57.46 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  57.36 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  57.21 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  57.36 
 
 		 400 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  56.31 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  56.39 
 
 		 400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  56.53 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  58.84 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  55.89 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2076  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  57.07 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1321  aromatic amino acid aminotransferase  57.76 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  55.81 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2971  aromatic amino acid aminotransferase  57.25 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600649  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3097  aromatic amino acid aminotransferase  57.25 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  55.81 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0225  aromatic amino acid aminotransferase  54.27 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  53.28 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1557  aromatic amino acid aminotransferase  53.27 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1403  aromatic amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000415206  normal  0.0752089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  52.53 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6526  aromatic amino acid aminotransferase  53.77 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.506561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  50.12 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  52.27 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  52.01 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  52.14 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  52.14 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  51.74 
 
 		 399 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  51.39 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3088  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  52.39 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  50.78 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  52.39 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  51.64 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  51.39 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  52.56 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  51.64 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  51.74 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  51.49 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>