49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2780 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3411  hypothetical protein  78.75 
 
 		 80 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2351  hypothetical protein  78.75 
 
 		 80 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2529  hypothetical protein  78.75 
 
 		 80 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.763354  hitchhiker  0.00703113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1036  hypothetical protein  63.75 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0580  hypothetical protein  64 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3443  hypothetical protein  65.33 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40610  hypothetical protein  64 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3484  hypothetical protein  64.86 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2781  protein of unknown function DUF1272  67.12 
 
 		 75 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2394  hypothetical protein  58.44 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0633  hypothetical protein  63.51 
 
 		 81 aa  97.1  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2387  hypothetical protein  61.33 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.652223  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5992  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2163  hypothetical protein  62.5 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162616  normal  0.033863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2053  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2693  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2664  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4946  hypothetical protein  61.33 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.054584  normal  0.404077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2219  hypothetical protein  60.81 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3311  protein of unknown function DUF1272  59.46 
 
 		 83 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0162  hypothetical protein  60.81 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.156045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2580  hypothetical protein  55 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.418372  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05427  hypothetical protein  56.58 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3055  protein of unknown function DUF1272  58.11 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2717  hypothetical protein  57.33 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2589  hypothetical protein  57.33 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1157  hypothetical protein  59.21 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0090  protein of unknown function DUF1272  54.67 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.1015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3174  protein of unknown function DUF1272  57.89 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0480  hypothetical protein  54.05 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4148  hypothetical protein  54.93 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000130778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0961  hypothetical protein  56.34 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3399  protein of unknown function DUF1272  55.84 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3033  hypothetical protein  51.52 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0121303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7015  protein of unknown function DUF1272  49.28 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232527  hitchhiker  0.00370389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0568  hypothetical protein  58.93 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2237  hypothetical protein  59.65 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0129  protein of unknown function DUF1272  48.05 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1267  protein of unknown function DUF1272  56.14 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3382  hypothetical protein  51.79 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2298  hypothetical protein  55.17 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159548  normal  0.783685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3407  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1849  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3426  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3405  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2140  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3395  hypothetical protein  49.09 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3100  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>