133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2765 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  88.5 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  88.5 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  88.05 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  72.57 
 
 		 226 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  66.98 
 
 		 226 aa  317  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  47.79 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  49.02 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  51.2 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  38.5 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  39.11 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  37.5 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  39.44 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  39.44 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  40.94 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  33.63 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  41.44 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  38.1 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  40.51 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  33.85 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  35.68 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  38.1 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  37.36 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  38.96 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  38.96 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  37.09 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  37.35 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  37.67 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  34.64 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  40.65 
 
 		 427 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  31.4 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  32.91 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  32.28 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  32.93 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  32.03 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  32.14 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.75 
 
 		 1018 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.75 
 
 		 1018 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  33.58 
 
 		 1040 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.07 
 
 		 1018 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 728 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  29.58 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  29.73 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  30 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.03 
 
 		 759 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  28.36 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.45 
 
 		 722 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.41 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  24.63 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  28.89 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  27.97 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.56 
 
 		 1013 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  25.16 
 
 		 734 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  27.27 
 
 		 1011 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.07 
 
 		 1717 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  24.63 
 
 		 727 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.32 
 
 		 716 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28 
 
 		 696 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.63 
 
 		 738 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  30.34 
 
 		 721 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  23.88 
 
 		 715 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 906 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  25.68 
 
 		 748 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  29.55 
 
 		 724 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 1038 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  24.44 
 
 		 695 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  26.98 
 
 		 908 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  27.41 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  28.77 
 
 		 727 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.69 
 
 		 707 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  30.34 
 
 		 727 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  27.07 
 
 		 706 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  29.55 
 
 		 724 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 906 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  28.89 
 
 		 706 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  28.89 
 
 		 706 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  28.89 
 
 		 706 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  29.63 
 
 		 741 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  24.18 
 
 		 714 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 1038 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25 
 
 		 908 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  28.15 
 
 		 706 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  28.68 
 
 		 695 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  28.69 
 
 		 721 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  26.47 
 
 		 714 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  28.05 
 
 		 726 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  28.46 
 
 		 721 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  21.53 
 
 		 724 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  26.95 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  29.79 
 
 		 521 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  26.47 
 
 		 732 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  26.13 
 
 		 719 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  32.86 
 
 		 688 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.63 
 
 		 743 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>