86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2717 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  86.18 
 
 		 463 aa  759    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  72.75 
 
 		 466 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  96.11 
 
 		 463 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  95.68 
 
 		 463 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  88.34 
 
 		 463 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  72.53 
 
 		 466 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  90.28 
 
 		 463 aa  814    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  76.18 
 
 		 466 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  70.54 
 
 		 465 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  76.91 
 
 		 463 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  78.4 
 
 		 463 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  96.33 
 
 		 463 aa  855    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  100 
 
 		 463 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  76.18 
 
 		 466 aa  689    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  88.55 
 
 		 463 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  74.46 
 
 		 466 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  73.43 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  73 
 
 		 463 aa  627  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  68.6 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  70.16 
 
 		 466 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  72.67 
 
 		 495 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  71.73 
 
 		 467 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  69.05 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  71.73 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  71.73 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  71.73 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  71.73 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  71.73 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  72.16 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  71.73 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  71.95 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  67.97 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  65.59 
 
 		 463 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  65.59 
 
 		 463 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  65.23 
 
 		 461 aa  581  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  60.86 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  65.73 
 
 		 466 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  66.24 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  56.99 
 
 		 479 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  55.65 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  56.28 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  56.34 
 
 		 478 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  56.07 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  56.28 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  56.34 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  56.28 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  56.07 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  56.28 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  56.49 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  56.34 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  56.34 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  45.4 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  47.3 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  45.53 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  45.43 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  45.53 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  47.96 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  49.2 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  46.36 
 
 		 481 aa  349  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  41.59 
 
 		 459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  41.45 
 
 		 459 aa  335  7e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  43.92 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  46.37 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  41.72 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  44.89 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  42.5 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  38.35 
 
 		 487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  40.64 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  39.83 
 
 		 484 aa  266  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  39.62 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  36.73 
 
 		 464 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  33.56 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  36.76 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  50.72 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  34.02 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  48.24 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  47.37 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  70.54 
 
 		 141 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  70.54 
 
 		 141 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  70.54 
 
 		 141 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  70.54 
 
 		 141 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>