More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2561 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
174 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  86.71 
 
 
174 aa  303  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  68.39 
 
 
174 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  68.39 
 
 
174 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  68.39 
 
 
174 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  67.24 
 
 
174 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  67.24 
 
 
174 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  67.24 
 
 
174 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  66.67 
 
 
174 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  66.67 
 
 
174 aa  233  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  65.52 
 
 
174 aa  231  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.52 
 
 
174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  64.94 
 
 
174 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  64.94 
 
 
174 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  67.24 
 
 
174 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  64.37 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  64.37 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  64.37 
 
 
192 aa  228  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  64.37 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  64.37 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  62.64 
 
 
194 aa  227  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  60.92 
 
 
174 aa  224  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  65.32 
 
 
175 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  61.27 
 
 
174 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  63.58 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  62.07 
 
 
174 aa  216  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  63.01 
 
 
175 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  61.85 
 
 
174 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  59.54 
 
 
174 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  56.9 
 
 
261 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  57.23 
 
 
174 aa  200  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  57.23 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  56.9 
 
 
174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  55.75 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  55.49 
 
 
175 aa  195  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  56.82 
 
 
176 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  55.49 
 
 
174 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  55.17 
 
 
174 aa  190  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  56 
 
 
176 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  54.02 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  53.25 
 
 
174 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  51.76 
 
 
173 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  57.39 
 
 
176 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  54.02 
 
 
174 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  55.11 
 
 
176 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  53.57 
 
 
174 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  53.85 
 
 
174 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  55.88 
 
 
178 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.35 
 
 
174 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  53.89 
 
 
174 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  54.02 
 
 
174 aa  185  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  52.87 
 
 
174 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  53.11 
 
 
176 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1556  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.78 
 
 
173 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  56.82 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  54.07 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  53.14 
 
 
177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  53.57 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  50 
 
 
176 aa  181  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  52.98 
 
 
174 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  54.97 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  54.29 
 
 
177 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  51.16 
 
 
175 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  53.57 
 
 
174 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  55.41 
 
 
174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  59.87 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  48.82 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  59.87 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  57.56 
 
 
177 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  52 
 
 
175 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  53.11 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  52.6 
 
 
178 aa  176  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.57 
 
 
177 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  49.13 
 
 
173 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  54.49 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  51.23 
 
 
174 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  52 
 
 
176 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5226  hypothetical protein  51.7 
 
 
176 aa  175  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  50.3 
 
 
175 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  50.3 
 
 
175 aa  174  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  52.98 
 
 
174 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.54 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0832  hexapaptide repeat-containing transferase  53.18 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  54.6 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  53.25 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  50.29 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  56.69 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  53.59 
 
 
178 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  47.65 
 
 
174 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  48.52 
 
 
177 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  51.27 
 
 
176 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  53.46 
 
 
174 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0032  hexapeptide repeat-containing transferase  47.93 
 
 
177 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  50.92 
 
 
173 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  47.67 
 
 
175 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2053  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 
173 aa  164  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0064  putative acetyltransferase/acyltransferase  47.34 
 
 
206 aa  163  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.949826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>