129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2420 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  89.29 
 
 		 224 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  89.29 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  89.29 
 
 		 224 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  55.76 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  53.12 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  46.02 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  43.95 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  48 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  46.02 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  44.34 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  41.83 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  41.15 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  39.04 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  37.02 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  45.54 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  35.91 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  38.71 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  40.09 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  36.91 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  38.5 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  45.16 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  38.29 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  37.83 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  41.99 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  38.74 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  36.12 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  37.33 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  38.46 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  34.47 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  38.79 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  37.84 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  38.29 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  38.01 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  38.01 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  38.01 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  37.84 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  34.8 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  34.67 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  39.46 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  37.61 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  39.46 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  41.38 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  37.83 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  37.29 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  36.64 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  38.36 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  37.56 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  36.56 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  38.1 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  36.48 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  32.89 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  33.8 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  31.85 
 
 		 269 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  32.62 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  36.53 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  36.56 
 
 		 288 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  31.82 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  36.04 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  32.29 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  32.27 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  39.21 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  37.86 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  32.89 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  33.19 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  35.22 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  26.24 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  34.55 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  34.48 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  35.78 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  32.87 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  34.65 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  23.61 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.57 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  32.14 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  22.13 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  22.13 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.94 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  32.31 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  30.04 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  34.5 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  34.06 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  29.07 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  21.78 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>