39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2394 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  89.57 
 
 
225 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  89.57 
 
 
216 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  87.04 
 
 
216 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  71.15 
 
 
216 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  63.43 
 
 
214 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  58.33 
 
 
223 aa  268  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  57.87 
 
 
223 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  57.21 
 
 
223 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  60.1 
 
 
210 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  60.62 
 
 
237 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  32.97 
 
 
215 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  32.07 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 
209 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  29.95 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  28.77 
 
 
213 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
212 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
215 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
216 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  19.13 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  25.4 
 
 
295 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  18.28 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  23.02 
 
 
295 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  22.46 
 
 
295 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>