28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2277 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  46.14 
 
 		 710 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  67.22 
 
 		 719 aa  1020    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  63.28 
 
 		 723 aa  932    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1494    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  39.48 
 
 		 702 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  30.08 
 
 		 726 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  30.08 
 
 		 726 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 830 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 830 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  27.17 
 
 		 824 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  30.36 
 
 		 660 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  29.86 
 
 		 662 aa  98.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  28.67 
 
 		 662 aa  92  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  25.78 
 
 		 677 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  25.28 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  21.9 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  27.2 
 
 		 601 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  24.74 
 
 		 588 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.89 
 
 		 612 aa  56.2  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  22.15 
 
 		 593 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  25.7 
 
 		 619 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.19 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.18 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  19.8 
 
 		 616 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.02 
 
 		 617 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 671 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.69 
 
 		 593 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  24.88 
 
 		 541 aa  45.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>