59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2266 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  28.81 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  26.19 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.59 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  24.43 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  30.23 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.54 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  28.7 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  26.48 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  26.48 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  26.48 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  26.48 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  27.05 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  22.26 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  26.7 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.36 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  21.71 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  26.42 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  25.94 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  23.61 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  20.21 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.93 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  24.15 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  26.73 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  23.83 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  24.02 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  22.75 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  22.75 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  31.66 
 
 		 556 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  24.02 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  21.76 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  22.6 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  28.57 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  25 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  25 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  20.31 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  22.92 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  22.92 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  25.82 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  22.34 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  28.39 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  24.03 
 
 		 562 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.18 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  21.57 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  22.22 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  23.93 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  27.08 
 
 		 568 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  25.42 
 
 		 545 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  33.77 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  33.77 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  33.77 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  33.77 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  33.77 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  20.69 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  20.69 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  20.69 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  20.69 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>