More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2226 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  88.29 
 
 		 227 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  88.29 
 
 		 227 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  87.44 
 
 		 223 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  66.34 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  65.85 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  60.09 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  58.04 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  45.89 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  40.97 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 243 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  46.3 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 255 aa  157  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2513  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.988711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  35.79 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  31 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  38.55 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>