More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2124 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  100 
 
 
348 aa  712  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  92.24 
 
 
348 aa  662  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  92.53 
 
 
348 aa  644  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  92.82 
 
 
348 aa  649  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  75.29 
 
 
348 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  59.6 
 
 
351 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  59.03 
 
 
351 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  59.03 
 
 
351 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  56.9 
 
 
353 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  59.03 
 
 
351 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  58.17 
 
 
351 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  55.46 
 
 
353 aa  399  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  56.45 
 
 
353 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  57.06 
 
 
348 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  54.62 
 
 
349 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  52.86 
 
 
358 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  52.44 
 
 
351 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  54.31 
 
 
357 aa  358  1e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  51.29 
 
 
360 aa  357  2e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  53.14 
 
 
351 aa  356  3e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  53.3 
 
 
357 aa  355  6e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  52.44 
 
 
360 aa  355  9e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  51.43 
 
 
353 aa  348  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  52.72 
 
 
359 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  47.85 
 
 
357 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  48.71 
 
 
350 aa  322  7e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  47.08 
 
 
343 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  37.22 
 
 
357 aa  202  1e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.22 
 
 
357 aa  199  8e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  37.93 
 
 
341 aa  172  8e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  36.06 
 
 
363 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
355 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  31.45 
 
 
356 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  31.16 
 
 
356 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
356 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
360 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  29.95 
 
 
416 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.7 
 
 
360 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
360 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
360 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.94862e-14 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
355 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
355 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
355 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
344 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
363 aa  137  3e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 
380 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  4.76854e-09  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  33.84 
 
 
365 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.7 
 
 
353 aa  134  2e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.66 
 
 
362 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  32.75 
 
 
369 aa  131  2e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
376 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  28.37 
 
 
365 aa  129  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
367 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
363 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
366 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
356 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  32.29 
 
 
418 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
268 aa  70.1  5e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
268 aa  70.1  5e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
283 aa  69.7  7e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
283 aa  68.9  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.72 
 
 
296 aa  68.6  2e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
286 aa  68.6  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  30 
 
 
351 aa  64.3  3e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.59 
 
 
280 aa  62.8  8e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
285 aa  62  1e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
274 aa  62.4  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
284 aa  62.4  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
285 aa  61.6  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
268 aa  60.8  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
293 aa  60.8  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
281 aa  60.8  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.33 
 
 
268 aa  60.8  4e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  27.91 
 
 
356 aa  60.1  6e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
285 aa  59.7  7e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  32 
 
 
283 aa  59.7  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
285 aa  59.7  7e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
276 aa  59.3  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
242 aa  58.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
242 aa  58.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
226 aa  57.4  3e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  24.7 
 
 
353 aa  57.8  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.7 
 
 
447 aa  57.4  3e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.21 
 
 
287 aa  57  4e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
263 aa  57  5e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
263 aa  57  5e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
263 aa  57  5e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
267 aa  56.6  6e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
229 aa  55.8  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  29.77 
 
 
268 aa  55.1  2e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
270 aa  55.1  2e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
228 aa  55.1  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
287 aa  54.7  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
440 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  54.3  3e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
271 aa  53.9  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
283 aa  53.5  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 
274 aa  53.5  6e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
269 aa  53.1  6e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
275 aa  53.5  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>