More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2077 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  91.72 
 
 		 157 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  91.08 
 
 		 157 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  91.72 
 
 		 157 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  58.71 
 
 		 162 aa  189  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  59.35 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  56.38 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  54.36 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  37.59 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 180 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  37.76 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  37.86 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  40.77 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  40.77 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  42.02 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  42.02 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  42.02 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  42.02 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  42.02 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  43.96 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>