More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2034 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  100 
 
 
357 aa  738    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  55.75 
 
 
349 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  55.87 
 
 
350 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  54.02 
 
 
352 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  53.37 
 
 
354 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
352 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  52.71 
 
 
352 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  52.99 
 
 
352 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  50.7 
 
 
359 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  50.73 
 
 
351 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  48.99 
 
 
355 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  54.15 
 
 
349 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  46.97 
 
 
353 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  46.99 
 
 
343 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
345 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
342 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
349 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  46.41 
 
 
389 aa  295  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  46.41 
 
 
344 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
343 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  44.57 
 
 
344 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  46.94 
 
 
344 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
344 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
345 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  46.94 
 
 
344 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
344 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
347 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  46.06 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
344 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  44.11 
 
 
340 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.48 
 
 
349 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
358 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  43.79 
 
 
342 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  45.2 
 
 
343 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  44.58 
 
 
349 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
345 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.78 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  43.81 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  43.81 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
345 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
348 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
345 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  45.67 
 
 
351 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
345 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
345 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  45.67 
 
 
351 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
349 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
351 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
338 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  45.48 
 
 
343 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  41.96 
 
 
341 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.9 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
349 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  43.11 
 
 
349 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
341 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.5 
 
 
338 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  44.08 
 
 
378 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  43.29 
 
 
345 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  43.24 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  42.04 
 
 
346 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  44.01 
 
 
370 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.74 
 
 
335 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.31 
 
 
343 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
351 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
361 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
343 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
343 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  40.76 
 
 
342 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  40.47 
 
 
342 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  40.47 
 
 
342 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
341 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
341 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  43.91 
 
 
333 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.06 
 
 
344 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
326 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  40 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
339 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
328 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
325 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
327 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  39.27 
 
 
326 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
348 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.95 
 
 
321 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
313 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
322 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  40.36 
 
 
344 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>