25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1948 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  80.97 
 
 		 244 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  82.11 
 
 		 244 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  80.97 
 
 		 244 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  57.41 
 
 		 224 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  54.88 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  55.67 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  39.25 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 		 326 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  39.25 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  42.07 
 
 		 172 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  36.28 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  32.03 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  30.58 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  35.2 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 310 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  34.2 
 
 		 317 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  25.79 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  28 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  25.58 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  21.53 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  23.6 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>