217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1925 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  100 
 
 		 445 aa  906    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  90.79 
 
 		 445 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  55.74 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  46.98 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  43.92 
 
 		 431 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  44.08 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  44.21 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  43.88 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  43.61 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  43.13 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  41.5 
 
 		 435 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  40.62 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  40.54 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  39.55 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  37.69 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  39.25 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  39.25 
 
 		 479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  38.29 
 
 		 425 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  38 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  41.08 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  39.45 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  40.35 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  38.73 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  42.79 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  40.98 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  36.53 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  38.99 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  38.86 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  36.66 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  37.39 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  37.89 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  38.55 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  37.05 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  34.86 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  34.86 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  34.86 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  34.86 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  36.87 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  36.81 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  37.73 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  36.57 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  35.27 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  36.78 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  38.11 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  35.44 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  36.76 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  38.27 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  35.88 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  37.25 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  36.67 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  35.24 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  35.59 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.56 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  37.56 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  34.8 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  34.8 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  35.78 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35.56 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  36.02 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  36.02 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  36.03 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  33.48 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  35.21 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.61 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  33.33 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  35.68 
 
 		 424 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  35.94 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  33.81 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  35.46 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  33.87 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.93 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  33.49 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  32.8 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  33.81 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  34.32 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  33.03 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  32.8 
 
 		 429 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  34.1 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  34.26 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  33.56 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  33.78 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  36.78 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  33.49 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  37.7 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  35.43 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  34.31 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  35.43 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  35.36 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  35.6 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  35.14 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  35.4 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  34.64 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  35.14 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  33.86 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  32.45 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  35.29 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  32.2 
 
 		 471 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  32.81 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  34.38 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  33.64 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>