More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1915 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 234 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  71.75 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  71.3 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  71.18 
 
 		 235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  48 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  46.22 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  46.46 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  45.58 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  45.78 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  45.58 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  47.42 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.57 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.18 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  35.47 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  32.88 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  35.47 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.34 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.09 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  31.13 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  32.89 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  32.89 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.3 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.3 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  32.86 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.89 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.23 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  33.5 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.01 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.57 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.96 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.95 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.87 
 
 		 243 aa  91.7  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  34.3 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 269 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.96 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.36 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.65 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.36 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.11 
 
 		 251 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.42 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.22 
 
 		 259 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.92 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.33 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  32.88 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.59 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  28.23 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.84 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.58 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>