More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1862 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  98.24 
 
 
510 aa  989    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  74.5 
 
 
511 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  69.23 
 
 
514 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  88.82 
 
 
510 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  89.02 
 
 
510 aa  837    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  81.07 
 
 
509 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 
510 aa  1001    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  75.1 
 
 
510 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  91.18 
 
 
510 aa  878    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  74.9 
 
 
511 aa  730    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  97.84 
 
 
510 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  73.57 
 
 
509 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  74.45 
 
 
509 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  73.57 
 
 
509 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  72.94 
 
 
509 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  71.31 
 
 
511 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  72.71 
 
 
532 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  67.8 
 
 
513 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  81.18 
 
 
509 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  98.63 
 
 
510 aa  991    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  80.78 
 
 
509 aa  773    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  75.1 
 
 
510 aa  740    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  75.1 
 
 
510 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  81.07 
 
 
509 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  73.77 
 
 
509 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  61.92 
 
 
541 aa  617  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  61.92 
 
 
541 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.2 
 
 
507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  57.07 
 
 
577 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.1 
 
 
500 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.37 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  55.45 
 
 
489 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.82 
 
 
490 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.98 
 
 
505 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.89 
 
 
537 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.23 
 
 
493 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.42 
 
 
497 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.47 
 
 
525 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.61 
 
 
493 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40.16 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  42.33 
 
 
522 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  39.77 
 
 
502 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.56 
 
 
519 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  45.5 
 
 
496 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  39.12 
 
 
502 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  39.12 
 
 
502 aa  349  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.56 
 
 
535 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.09 
 
 
535 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.42 
 
 
496 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.86 
 
 
481 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.01 
 
 
495 aa  342  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.02 
 
 
519 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.7 
 
 
480 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.57 
 
 
507 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  39.83 
 
 
494 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.95 
 
 
480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  40.65 
 
 
503 aa  339  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.84 
 
 
481 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.52 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.74 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.67 
 
 
504 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.13 
 
 
514 aa  335  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.45 
 
 
503 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.64 
 
 
517 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.54 
 
 
534 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  38.04 
 
 
496 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.48 
 
 
503 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.48 
 
 
503 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  40.37 
 
 
494 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.37 
 
 
494 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  38.27 
 
 
489 aa  331  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  39.61 
 
 
510 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.49 
 
 
542 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  37.84 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.29 
 
 
542 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.29 
 
 
542 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  40.16 
 
 
505 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  38.85 
 
 
496 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  38.65 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  40.85 
 
 
502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  38.65 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  38.76 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  38.65 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.57 
 
 
496 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  39.88 
 
 
505 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.84 
 
 
506 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  38.65 
 
 
496 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.57 
 
 
496 aa  326  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.57 
 
 
496 aa  326  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>