156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1849 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  86.99 
 
 		 371 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  84.11 
 
 		 373 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  100 
 
 		 369 aa  760    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  71.86 
 
 		 368 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  70.77 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  55.07 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  53.57 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  57.78 
 
 		 374 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  53.59 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  52.23 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  50.95 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  51.08 
 
 		 366 aa  381  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  50.95 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  50.68 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  52.47 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  51.79 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  52.75 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  53.59 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  49.32 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  51.76 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  51.37 
 
 		 368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  49.44 
 
 		 370 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  49.44 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  49.04 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  49.17 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  50.28 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  48.89 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  48.89 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  49.17 
 
 		 370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  49.17 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  48.76 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  48.6 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  47.9 
 
 		 375 aa  348  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  46.94 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  47.74 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  46.15 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  47.78 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  48.06 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  44.85 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  44.85 
 
 		 371 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  44.85 
 
 		 371 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  44.44 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  40.79 
 
 		 386 aa  288  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  41.55 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.74 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.19 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.95 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  37.74 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  37 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  34.64 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  35.65 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.38 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.07 
 
 		 624 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.15 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.07 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.61 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  29.26 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.53 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  36.16 
 
 		 340 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.87 
 
 		 640 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  34.26 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.43 
 
 		 346 aa  195  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.69 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  32.71 
 
 		 639 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.87 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.87 
 
 		 631 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  32.59 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  32.5 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  33.8 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  31.16 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  32.31 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  30.94 
 
 		 347 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.73 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  36.03 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.35 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  32.77 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.86 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  34.64 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  36.47 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  36.66 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  31.25 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  33.8 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.47 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  31.3 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  32.35 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  34.72 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  33.33 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  29.74 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  33.05 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  32.87 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  32.34 
 
 		 364 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  34.17 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  33.92 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  30.05 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  32.59 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  31.99 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>