More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1816 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  54.01 
 
 		 1102 aa  1129    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  46.35 
 
 		 1111 aa  916    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  92.49 
 
 		 1106 aa  2127    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  48.04 
 
 		 1119 aa  1003    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  57.65 
 
 		 1100 aa  1269    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  58.51 
 
 		 1160 aa  1272    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  58.27 
 
 		 1137 aa  1260    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  43.9 
 
 		 1116 aa  900    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  48.83 
 
 		 1101 aa  1036    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  73.96 
 
 		 1108 aa  1660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  57.91 
 
 		 1137 aa  1257    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  45.1 
 
 		 1098 aa  946    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  91.58 
 
 		 1106 aa  2109    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  60.81 
 
 		 548 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  65.02 
 
 		 572 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  54.34 
 
 		 1088 aa  1129    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  56.96 
 
 		 1131 aa  1235    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  73.87 
 
 		 1108 aa  1659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  61.5 
 
 		 606 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  57.14 
 
 		 1121 aa  1275    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  49.54 
 
 		 1095 aa  986    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  49.95 
 
 		 1094 aa  1024    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  51.02 
 
 		 1104 aa  1078    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  74.03 
 
 		 1113 aa  1692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  57.63 
 
 		 1164 aa  1272    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  54.37 
 
 		 1102 aa  1135    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  57.57 
 
 		 1138 aa  1243    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  44.72 
 
 		 1100 aa  935    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  52.07 
 
 		 1109 aa  1078    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  45.72 
 
 		 1098 aa  949    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  57.81 
 
 		 1093 aa  1264    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  45.37 
 
 		 1112 aa  920    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  43.93 
 
 		 1110 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  57.03 
 
 		 1136 aa  1253    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  52.47 
 
 		 1098 aa  1090    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  60.26 
 
 		 551 aa  704    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  48.76 
 
 		 1100 aa  981    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  54.52 
 
 		 1100 aa  1160    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  100 
 
 		 1105 aa  2266    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  65.57 
 
 		 572 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  43.82 
 
 		 1105 aa  928    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  61.9 
 
 		 574 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  92.4 
 
 		 1106 aa  2125    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  52.35 
 
 		 1100 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  59.89 
 
 		 596 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  51.17 
 
 		 1112 aa  1078    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  54.35 
 
 		 1088 aa  1131    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  51.6 
 
 		 1099 aa  1062    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  53.01 
 
 		 1092 aa  1125    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  57.09 
 
 		 1134 aa  1244    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  58.44 
 
 		 1154 aa  1287    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  57.05 
 
 		 1131 aa  1239    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  58.12 
 
 		 1101 aa  1253    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  51.58 
 
 		 1100 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  43.9 
 
 		 1116 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  50.64 
 
 		 1088 aa  1050    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  45.07 
 
 		 1099 aa  936    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  50.04 
 
 		 1094 aa  1025    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  44.68 
 
 		 1108 aa  897    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  46.79 
 
 		 1123 aa  924    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  56.26 
 
 		 556 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  57.96 
 
 		 1061 aa  1219    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  58.53 
 
 		 1154 aa  1296    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  57.05 
 
 		 1131 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  57.82 
 
 		 1137 aa  1255    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  49.22 
 
 		 1085 aa  977    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  59.89 
 
 		 596 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  52.66 
 
 		 1121 aa  1135    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  66.48 
 
 		 553 aa  785    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  55.05 
 
 		 1115 aa  1184    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  57.55 
 
 		 1093 aa  1261    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  57.43 
 
 		 1152 aa  1273    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  62.89 
 
 		 572 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  59.43 
 
 		 1110 aa  1333    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  45.11 
 
 		 1105 aa  933    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  57.05 
 
 		 1131 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  58.45 
 
 		 1137 aa  1261    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  68.3 
 
 		 1100 aa  1491    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  68.21 
 
 		 1100 aa  1488    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  53.79 
 
 		 1088 aa  1135    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  58.53 
 
 		 601 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  57.63 
 
 		 1164 aa  1272    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  67.31 
 
 		 1100 aa  1498    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  43.3 
 
 		 1130 aa  889    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  54.3 
 
 		 1088 aa  1115    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  45.04 
 
 		 1113 aa  917    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  65.02 
 
 		 553 aa  768    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  57.82 
 
 		 1137 aa  1255    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  62.3 
 
 		 556 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  43.81 
 
 		 1121 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  45.13 
 
 		 1098 aa  939    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  59.61 
 
 		 571 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  70.66 
 
 		 1108 aa  1565    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  59.89 
 
 		 596 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  51.9 
 
 		 1100 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  55.5 
 
 		 1102 aa  1152    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  47.29 
 
 		 1108 aa  970    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  51.26 
 
 		 1142 aa  1043    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  57.05 
 
 		 1131 aa  1238    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  57.05 
 
 		 1131 aa  1238    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>