57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1786 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  100 
 
 		 104 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  95.19 
 
 		 104 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  95.19 
 
 		 104 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  92.31 
 
 		 104 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  71.76 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  68.09 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  62.63 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  68.57 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  67.68 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  74.07 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  60.2 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  45.37 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  45.92 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  45.92 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  47.78 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  46.74 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  43.75 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  44.12 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  39.39 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.36 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  39.39 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  40 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  40.51 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  38.75 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  46.05 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  32.58 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  48.53 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  38.36 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.89 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  37.84 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  37.84 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  36.49 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  36.49 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  36.14 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  35.48 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.49 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  34.62 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  31.63 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  35.14 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  36.99 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  35.8 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  37.5 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  35.29 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  35.62 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.72 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  37.68 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  36.99 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  33.77 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5445  hypothetical protein  30.26 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0704203  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  39.44 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>