More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1690 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  100 
 
 		 367 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  55.56 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  45.22 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  39.73 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  39.73 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  39.73 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  39.46 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  38.29 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  38.29 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  38.95 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  38.29 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  38.29 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  38.29 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  36.78 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  36.78 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  40 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  35.88 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  35.77 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  37.39 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  32.88 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  33.88 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  32.63 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  34.17 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  35.91 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  37.19 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  32.01 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  34.5 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  35.54 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  35.34 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  34.99 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  35.07 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  35.52 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  33.71 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  32.7 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  30.54 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  28.23 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  28.27 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  29.06 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  29.06 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  29.06 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  28.08 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  28.08 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  27.36 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  28.5 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  28 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  28 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  27.89 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  27.97 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 		 378 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  28.86 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  29.25 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  25.89 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  26.86 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  28.34 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>