36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1627 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  100 
 
 
143 aa  290  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  65.73 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  65.73 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  62.94 
 
 
143 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  47.83 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  38.69 
 
 
146 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  42.34 
 
 
162 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  39.55 
 
 
236 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  44.12 
 
 
165 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  39.86 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  39.6 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  33.54 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  39.18 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  32.23 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  41.89 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  44.07 
 
 
459 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  42.37 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  40.68 
 
 
421 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  41.82 
 
 
426 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  31.71 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  36.78 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  36.9 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 
341 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  36.9 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  36.9 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  27.88 
 
 
513 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  36.21 
 
 
347 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  38.24 
 
 
224 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  48.72 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  36.21 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  41.54 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  32.67 
 
 
1050 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  32 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  38.03 
 
 
246 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  47.73 
 
 
242 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1289  hypothetical protein  35.82 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.0554205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>