More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1550 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  93.7 
 
 
254 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  93.7 
 
 
254 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  92.91 
 
 
254 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  83.53 
 
 
255 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  70.12 
 
 
253 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  65.71 
 
 
261 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  60.89 
 
 
256 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  55.91 
 
 
256 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  56.63 
 
 
257 aa  292  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  59.2 
 
 
255 aa  289  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.27 
 
 
256 aa  289  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  58.27 
 
 
256 aa  288  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  58.27 
 
 
256 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  58.27 
 
 
256 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  57.87 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  56.3 
 
 
256 aa  285  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.91 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  56.3 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.91 
 
 
256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  56.05 
 
 
258 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 
256 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  52.82 
 
 
250 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  68.28 
 
 
187 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  52.61 
 
 
261 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  53.88 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  55.28 
 
 
251 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  53.47 
 
 
250 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  53.47 
 
 
250 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  54.29 
 
 
250 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  54.62 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  52.42 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  53.19 
 
 
256 aa  251  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  52.59 
 
 
259 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  53.06 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  53.82 
 
 
259 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  52.03 
 
 
256 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  53.06 
 
 
250 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.88 
 
 
251 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.88 
 
 
251 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  52.65 
 
 
250 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.47 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  51.84 
 
 
250 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.07 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.07 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.07 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  54.07 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  46.8 
 
 
264 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  51.39 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  50.82 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  50.82 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  51.68 
 
 
254 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  51.68 
 
 
254 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.59 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  55.67 
 
 
207 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  55.67 
 
 
207 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  55.17 
 
 
207 aa  221  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  55.17 
 
 
207 aa  221  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  50.79 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  54.19 
 
 
207 aa  218  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  56.99 
 
 
212 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  56.99 
 
 
204 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  48.78 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  57.06 
 
 
173 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.08 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.08 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.08 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.08 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.47 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
264 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.68 
 
 
261 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.68 
 
 
261 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.68 
 
 
261 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.68 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  31.09 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.16 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  46.9 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.51 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.36 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.76 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  37.67 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  36.77 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.02 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  38.56 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.68 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  44.86 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.86 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.71 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.28 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.59 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.61 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  46.39 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.39 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.19 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>