More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1393 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 310 aa  634    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  83.55 
 
 		 310 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  79.35 
 
 		 317 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  60.84 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  57.52 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  52.79 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  52.46 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  52.46 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  53.38 
 
 		 315 aa  325  7e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  52.73 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  53.38 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  53.22 
 
 		 319 aa  322  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  54.49 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  51.46 
 
 		 329 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  52.09 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.47 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  48.23 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  50.65 
 
 		 310 aa  298  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  52.04 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.32 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.32 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  50.32 
 
 		 351 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  54.18 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.76 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  47.37 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.54 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  48.25 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.76 
 
 		 326 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  49.66 
 
 		 333 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.25 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 333 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  49.03 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.12 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 		 329 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.12 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.88 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  46.28 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.57 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.63 
 
 		 315 aa  271  9e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  45.75 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.25 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.98 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  46.28 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  47.23 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.34 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  46.96 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  51.31 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  47.59 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.25 
 
 		 324 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  47.33 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.93 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  49.03 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  44.98 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  43.13 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  43.13 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.91 
 
 		 324 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  44.37 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  49.35 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  43.83 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  44.05 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 327 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  48.06 
 
 		 328 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.74 
 
 		 327 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  49.03 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.55 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.21 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  43.73 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  49.48 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  46.95 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  49.48 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>