More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1390 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
539 aa  1107    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
441 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
403 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
447 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.7 
 
 
401 aa  140  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  29.33 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
440 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
782 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  27.34 
 
 
778 aa  124  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
392 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
403 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  26.83 
 
 
425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
425 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
466 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
403 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 
397 aa  120  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
436 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
392 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.7 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
733 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
800 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
390 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
393 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
391 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
418 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
440 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
924 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
424 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.65 
 
 
384 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
404 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
445 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
392 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
415 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
452 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
417 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.13 
 
 
426 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
1303 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
413 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
372 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 
401 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
410 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
397 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
414 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
409 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
418 aa  97.8  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
405 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
381 aa  97.1  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
426 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.75 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
404 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
1301 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
404 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
405 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
370 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
404 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
394 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
392 aa  94  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
414 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.96 
 
 
412 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
426 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
399 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
409 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
399 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
380 aa  91.7  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
445 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
407 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
377 aa  90.5  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
399 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
1220 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
1265 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
1271 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.87 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
404 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
367 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
391 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
406 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
396 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
376 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  26.85 
 
 
389 aa  88.2  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
424 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
426 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  27.51 
 
 
402 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  24.79 
 
 
1147 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
396 aa  87  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
412 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  27 
 
 
406 aa  87  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>