More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1387 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  100 
 
 		 402 aa  830    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  53.77 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  50.12 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  47.99 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  52.23 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  52.23 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  48.49 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  49.88 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  43.26 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  39.08 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.28 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  42.35 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  36.69 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  37.77 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.65 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  42.19 
 
 		 449 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.43 
 
 		 450 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  43.06 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  39.47 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  38.83 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.39 
 
 		 870 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  40.96 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35.56 
 
 		 455 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  37.06 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  36.92 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.9 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  40.78 
 
 		 488 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  37.47 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.67 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 448 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  47.91 
 
 		 493 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  48.1 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  36.74 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  35.08 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  36.29 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  36.18 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  35.29 
 
 		 410 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  47.77 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.9 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 		 594 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  52.58 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  35.9 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  35.04 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  40.5 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  37.25 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  37.25 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  42.86 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  50.23 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  35.83 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  36.74 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  38.32 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  49.19 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.77 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.39 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  35.69 
 
 		 711 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  36.62 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  37.64 
 
 		 437 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.63 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.88 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  35.69 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 465 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 465 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 465 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 465 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 471 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  39.21 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  33.83 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  39.79 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  45.96 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  42.67 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  50.25 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  32.69 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  38.22 
 
 		 420 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  37.97 
 
 		 816 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  51.01 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  45.04 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 439 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  40.32 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  37.69 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  34.11 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  42.56 
 
 		 246 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  38.77 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  50.5 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  39.86 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  34.46 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  53.09 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  42.24 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  44.31 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  49.02 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  40.62 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>