87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1338 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
248 aa  503  1e-142  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  90.91 
 
 
233 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  63.39 
 
 
228 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  57.26 
 
 
240 aa  261  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  56.28 
 
 
231 aa  248  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  39.02 
 
 
216 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  39.02 
 
 
216 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  39.32 
 
 
371 aa  132  4e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  39.7 
 
 
233 aa  119  4e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  38.62 
 
 
219 aa  113  2e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  39.04 
 
 
222 aa  112  4e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  39.04 
 
 
222 aa  112  4e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  39.53 
 
 
177 aa  112  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  41.5 
 
 
177 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  35.45 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  39.35 
 
 
177 aa  106  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  40.36 
 
 
189 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  39.35 
 
 
176 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  37.25 
 
 
172 aa  102  5e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  37.67 
 
 
243 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  38.18 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  41.1 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  40 
 
 
177 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  39.33 
 
 
177 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  36.76 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  40.41 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  41.26 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  40.41 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  39.16 
 
 
215 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  38.46 
 
 
215 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  37.97 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  44.53 
 
 
156 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  43.8 
 
 
156 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  36.42 
 
 
174 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  34.97 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  32.27 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  43.8 
 
 
157 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  39.72 
 
 
205 aa  85.9  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  35.56 
 
 
579 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  40.3 
 
 
187 aa  83.6  3e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  39.6 
 
 
185 aa  82.8  5e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  41.61 
 
 
184 aa  82.4  6e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  39.55 
 
 
187 aa  81.6  1e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  38.46 
 
 
150 aa  80.9  2e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  34.52 
 
 
244 aa  80.9  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  40.46 
 
 
144 aa  79  7e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  38.35 
 
 
190 aa  77.8  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  35.62 
 
 
165 aa  74.7  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  40 
 
 
159 aa  74.7  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 
187 aa  74.3  1e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  34.75 
 
 
149 aa  68.2  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  32.14 
 
 
168 aa  65.5  7e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  31.43 
 
 
171 aa  64.7  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  32.64 
 
 
186 aa  62.8  5e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  30.82 
 
 
165 aa  62  8e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.03 
 
 
180 aa  58.2  1e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  34.62 
 
 
646 aa  58.5  1e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  35.77 
 
 
139 aa  58.2  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  33.55 
 
 
198 aa  56.2  4e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  28.33 
 
 
526 aa  55.5  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  30.92 
 
 
526 aa  55.5  8e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30.92 
 
 
526 aa  55.5  9e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  34.51 
 
 
645 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  34.51 
 
 
645 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01798e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  31.45 
 
 
649 aa  53.5  3e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  34.51 
 
 
645 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04536e-05 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  28.97 
 
 
167 aa  52.8  5e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  26.36 
 
 
196 aa  50.4  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  31.03 
 
 
165 aa  50.8  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  26.36 
 
 
196 aa  50.4  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  31.03 
 
 
165 aa  50.8  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  29.17 
 
 
248 aa  49.3  6e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  27.33 
 
 
206 aa  49.3  6e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  29.77 
 
 
194 aa  48.9  7e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  27.07 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  30.71 
 
 
186 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  30.56 
 
 
177 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  27.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  27.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  27.97 
 
 
177 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  30.56 
 
 
661 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  30.56 
 
 
661 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  28.57 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  28.57 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  28.57 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  29.1 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  30.91 
 
 
659 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>