More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1319 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  51 
 
 
260 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  40.64 
 
 
268 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  39.11 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  39.34 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  45.5 
 
 
257 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  42.71 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  42.71 
 
 
284 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  42.21 
 
 
286 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  39.23 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  34.02 
 
 
245 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  34.02 
 
 
245 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  34.02 
 
 
245 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  34.02 
 
 
245 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  34.02 
 
 
245 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  33.51 
 
 
245 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  29.9 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  29.9 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  29.9 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  29.9 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  32.99 
 
 
245 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  30.99 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  35.23 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  35.23 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  35.23 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  28.88 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  22.47 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  32.03 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  27.42 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  28.89 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  24 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  28.82 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  30.6 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  26.83 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  28.08 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  25.61 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  29.33 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  29.33 
 
 
297 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  29.33 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.25 
 
 
293 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  25.16 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.35 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  26.57 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  31.51 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  31.51 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  27.27 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  26.47 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  29.23 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  29.76 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.85 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  28.95 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  28.95 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.67 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  26.45 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  28.46 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  24.54 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  27.57 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  31.4 
 
 
469 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  28.12 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  28.46 
 
 
470 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  23.53 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  30 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  25.35 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0933  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1998  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0943  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1007  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1257  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00361337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0923  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1255  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000529674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1245  IstB domain protein ATP-binding protein  34.35 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  26.21 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  34.82 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  32.46 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  32.73 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  31.82 
 
 
489 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0049  transposase/IS protein  32.46 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  31.82 
 
 
491 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>